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Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  24 lines
  1. *****************************************
  2. * Triosephosphate isomerase active site *
  3. *****************************************
  4.  
  5. Triosephosphate isomerase (EC 5.3.1.1) (TIM) [1] is the glycolytic enzyme that
  6. catalyzes  the  reversible  interconversion  of glyceraldehyde 3-phosphate and
  7. dihydroxyacetone phosphate.  TIM plays an important role  in several metabolic
  8. pathways and  is  essential  for efficient energy production. It is a dimer of
  9. identical subunits, each of which is made up of about 250 amino-acid residues.
  10. A glutamic  acid  residue  is  involved  in  the  catalytic mechanism [2]. The
  11. sequence around  the  active site  residue is perfectly conserved in all known
  12. TIM's and can be used as a signature pattern for this type of enzyme.
  13.  
  14. -Consensus pattern: A-Y-E-P-[LIVM]-W-[SA]-I-G-T-G
  15.                     [E is the active site residue]
  16. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  17. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  18. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  19.  
  20. [ 1] Lolis E., Alber T., Davenport R.C., Rose D., Hartman F.C., Petsko G.A.
  21.      Biochemistry 29:6609-6618(1990).
  22. [ 2] Knowles J.R.
  23.      Nature 350:121-124(1991).
  24.